空气通过前面开口进入生物安全柜的速度为0.38～0.5ml/s。如此速度的定向气流极易受到干扰，人员走近生物安全柜所形成的气流、送风系统调整以及开关门窗等都可能造成影响。因此，理想的是，将生物安全柜安装在远离人员活动、物品流动以及可能扰乱气流的部位。在安全柜的后方以及每一个侧面应尽可能留有30cm左右的空间，以利于对安全柜的清洁和维护：在安全柜上面应留有30～35cm的空间，以便准确测量空气通过排风过滤器的速度和排风过滤器的更换。